More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1333 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  80.58 
 
 		 141 aa  221  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.67 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  65.03 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.55 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  62.12 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.14 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 146 aa  150  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.12 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  52.14 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.04 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.71 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 147 aa  121  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.39 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.59 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  44.06 
 
 		 152 aa  119  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  42.45 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 191 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.43 
 
 		 142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 193 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  43.57 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.84 
 
 		 165 aa  116  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  43.57 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.39 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.68 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  41.55 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  42.66 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  44.29 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.76 
 
 		 156 aa  114  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.37 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>