More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  80.58 
 
 		 141 aa  221  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  76.43 
 
 		 145 aa  218  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  70 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.86 
 
 		 151 aa  189  8e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 		 147 aa  186  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  68.84 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  67.42 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  65 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  64.49 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  65.67 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  61.03 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.45 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.86 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  55.32 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.52 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.45 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.55 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.32 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  42.14 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  41.43 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  50.35 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 193 aa  120  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  42.14 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.32 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.76 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.77 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.29 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  43.26 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  44.29 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  43.88 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  43.88 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  41.01 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  40.29 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 193 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 193 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>