More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2415 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  296  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  72.14 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  65.19 
 
 		 146 aa  176  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  62.32 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 144 aa  159  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  61.07 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.29 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  59.42 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.24 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.32 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 149 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.52 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  44.93 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.76 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 153 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 193 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 153 aa  123  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.07 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.18 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 177 aa  122  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 193 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 193 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 193 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  44.06 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  42.66 
 
 		 156 aa  120  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.24 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.37 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  51.08 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  42.25 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>