More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1437 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  70.21 
 
 		 150 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  63.85 
 
 		 130 aa  175  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  56.08 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 150 aa  151  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.75 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 176 aa  146  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.72 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 177 aa  141  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 145 aa  141  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 150 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  48.67 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.76 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  48.65 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 193 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  44.6 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  43.07 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  41.43 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  43.88 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  48.85 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 147 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 191 aa  133  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 193 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.06 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 193 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.93 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.45 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>