More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5319 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 149 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  65.75 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  65.75 
 
 		 147 aa  190  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.14 
 
 		 144 aa  189  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  64.34 
 
 		 146 aa  186  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  65.19 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  65.96 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 151 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 151 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 151 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  66.42 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  65.96 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  65.96 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  62.67 
 
 		 193 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  60.27 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  62.67 
 
 		 193 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  63.27 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  63.27 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  63.27 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  63.27 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  61.64 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  64.54 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  60.96 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  62.16 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  62.16 
 
 		 148 aa  174  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 156 aa  169  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  59.33 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  60.69 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  56.38 
 
 		 152 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  56.38 
 
 		 149 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.03 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 153 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 150 aa  157  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 157 aa  156  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.97 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 176 aa  156  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.48 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  52.48 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.73 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  54.73 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  55.8 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 		 158 aa  149  8.999999999999999e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.68 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.28 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.35 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.41 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>