More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1784 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 147 aa  292  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4683  3-dehydroquinate dehydratase  93.15 
 
 		 147 aa  246  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10625  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  64.18 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  65.69 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  64.18 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 146 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 154 aa  166  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 193 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.04 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 150 aa  165  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 193 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 207 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 193 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 207 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  60.9 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 193 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  55.71 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.74 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.83 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 152 aa  159  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 151 aa  159  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.45 
 
 		 184 aa  154  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.24 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 145 aa  153  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 167 aa  153  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 176 aa  151  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.75 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>