More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4683 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4683  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10625  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  93.15 
 
 		 147 aa  258  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.45 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 193 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 146 aa  167  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  61.19 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 207 aa  167  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 151 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  54.48 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 207 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 193 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 207 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 193 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 152 aa  163  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.74 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.12 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  58.22 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.45 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.24 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 176 aa  150  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>