More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1000 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 146 aa  290  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  64.38 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  67.38 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  65.96 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  67.41 
 
 		 145 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  67.41 
 
 		 145 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  63.77 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.41 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  58.99 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 193 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 193 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 193 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 193 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.26 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.8 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.9 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1369  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.99 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 148 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.48 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.1 
 
 		 145 aa  146  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 148 aa  146  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.88 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  54.2 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.37 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 146 aa  141  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  50.37 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.41 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>