More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2391 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
144 aa  207  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 
144 aa  201  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.54 
 
 
149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  67.69 
 
 
149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 
141 aa  186  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.42 
 
 
151 aa  184  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 
146 aa  177  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 
148 aa  177  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.99 
 
 
145 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 
143 aa  175  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 
143 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.63 
 
 
145 aa  167  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
143 aa  166  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 
144 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 
141 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
148 aa  160  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
145 aa  157  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
145 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
145 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
145 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
145 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 
145 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
161 aa  150  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 
146 aa  150  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 
147 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 
150 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
146 aa  147  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
145 aa  148  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.8 
 
 
144 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  52.14 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.74 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.03 
 
 
165 aa  143  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
151 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.92 
 
 
156 aa  141  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
176 aa  141  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
149 aa  140  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  52.82 
 
 
146 aa  140  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.91 
 
 
148 aa  140  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
155 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
151 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.82 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
144 aa  137  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
148 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 
146 aa  137  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
144 aa  137  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
154 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
148 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
148 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
193 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
149 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.91 
 
 
144 aa  135  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
144 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 
148 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
148 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 
146 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 
153 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
193 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
151 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
151 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
151 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
151 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  43.36 
 
 
176 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
147 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
142 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  43.36 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 
146 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>