More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1306 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
149 aa  298  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  78.1 
 
 
144 aa  225  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  75.91 
 
 
144 aa  217  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  72.34 
 
 
149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  67.14 
 
 
147 aa  208  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  67.38 
 
 
141 aa  191  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  68.57 
 
 
145 aa  190  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  64.29 
 
 
143 aa  187  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 
143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.64 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 
141 aa  173  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.71 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  61.03 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 
146 aa  167  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 
145 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 
145 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  57.45 
 
 
145 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 
150 aa  157  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 
161 aa  157  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 
145 aa  157  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 
147 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.05 
 
 
146 aa  154  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
176 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
150 aa  151  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.18 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
147 aa  151  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
145 aa  150  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.32 
 
 
148 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.67 
 
 
156 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
148 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
151 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
145 aa  147  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 
145 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
149 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
145 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
193 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
152 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
144 aa  143  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
151 aa  143  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  144  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
148 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
151 aa  143  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.52 
 
 
148 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
149 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
193 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
193 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 
151 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  48.67 
 
 
151 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  49.33 
 
 
151 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
193 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
146 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 
146 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
148 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
147 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 
146 aa  140  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 
146 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.15 
 
 
156 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 
142 aa  139  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 
152 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 
150 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.23 
 
 
144 aa  137  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  46.26 
 
 
156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
142 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.52 
 
 
142 aa  137  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 
149 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
155 aa  136  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 
151 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
150 aa  136  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>