More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1848 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  93.01 
 
 		 143 aa  270  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  74.13 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  71.83 
 
 		 146 aa  209  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.21 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  65.96 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  65.22 
 
 		 145 aa  186  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  65.22 
 
 		 145 aa  186  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  65.22 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  64.34 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 		 144 aa  184  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  64.12 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.31 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 146 aa  166  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 193 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.82 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 145 aa  155  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 176 aa  153  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 193 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 193 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 193 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.48 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.55 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 156 aa  151  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  53.02 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 156 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 148 aa  149  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.28 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 151 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 146 aa  146  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.72 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 161 aa  139  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.21 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.32 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  51.52 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  51.52 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4106  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.01 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.49 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>