More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1267 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
146 aa  300  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 
145 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 
147 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 
146 aa  168  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
176 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
148 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 
153 aa  167  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
176 aa  166  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
157 aa  166  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 
148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 
148 aa  160  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.14 
 
 
144 aa  159  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
155 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 
146 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
156 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
149 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
151 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
156 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
147 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
146 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 
147 aa  156  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
151 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 
148 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
151 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
156 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
193 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
193 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  57.58 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  57.58 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  57.58 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
151 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
193 aa  153  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 
160 aa  153  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.96 
 
 
142 aa  153  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
151 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  56.69 
 
 
130 aa  153  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  56.06 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 
148 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  56.82 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  56.06 
 
 
151 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 
146 aa  152  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 
145 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
152 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 
147 aa  150  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 
147 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
151 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
147 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
154 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 
149 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
148 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
146 aa  148  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.83 
 
 
145 aa  148  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 
147 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
151 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 
150 aa  147  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
177 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 
141 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
149 aa  144  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  48.91 
 
 
153 aa  144  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
149 aa  144  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
150 aa  143  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 
149 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
152 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 
144 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 
158 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.18 
 
 
156 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.48 
 
 
150 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
150 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 
148 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
149 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 
145 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
156 aa  140  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 
144 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.09 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.86 
 
 
165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.68 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.53 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>