More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3143 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  63.57 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 193 aa  189  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  67.14 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  64.34 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 151 aa  183  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 193 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 193 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 193 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  65.94 
 
 		 146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.86 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.99 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  60.58 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 146 aa  163  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.85 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.43 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.8 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.82 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  50.67 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17900  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348774  normal  0.621032 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  49.28 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.29 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1369  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.4 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.29 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>