More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4497 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 149 aa  312  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  86.9 
 
 		 148 aa  269  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  86.3 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5818  3-dehydroquinate dehydratase  81.34 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  77.46 
 
 		 145 aa  235  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  76.06 
 
 		 145 aa  233  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  74.66 
 
 		 149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  77.86 
 
 		 147 aa  231  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3003  3-dehydroquinate dehydratase  74.65 
 
 		 145 aa  226  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216438  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2690  3-dehydroquinate dehydratase  73.24 
 
 		 145 aa  221  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  69.23 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  68.7 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4099  3-dehydroquinate dehydratase  78 
 
 		 120 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0790869  normal  0.677158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.03 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.34 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.91 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 150 aa  146  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 207 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.06 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.21 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 207 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  47.33 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 172 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.18 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  43.24 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.58 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  43.24 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.37 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  43.24 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.44 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1369  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.26 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  43.66 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  44.14 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  44.14 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  43.66 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  42.66 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.14 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.32 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>