More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2570 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3224  3-dehydroquinate dehydratase  76.6 
 
 		 151 aa  218  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 152 aa  159  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  53.69 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.57 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 		 193 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 		 176 aa  146  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  50.35 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  46.31 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  46.31 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 157 aa  143  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  44.97 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  44.3 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  44.59 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.44 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  44.85 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.21 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 177 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.84 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.87 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  45.52 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  47.37 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.1 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>