47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1523 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  100 
 
 		 221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  77.88 
 
 		 221 aa  360  9e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  41.24 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  39.39 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  40.4 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  39.39 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  35.68 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  37.38 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  33.65 
 
 		 487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  36.84 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  36.84 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  33.99 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  33.83 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  37.33 
 
 		 754 aa  90.9  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  37.32 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  50.79 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  27.52 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  35.17 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  27.12 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  25.35 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  27.85 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  30.06 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  26.92 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  36.05 
 
 		 376 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  26.95 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  30.12 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  28.83 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  40.68 
 
 		 691 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  31.65 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  45.45 
 
 		 463 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  29.52 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00291  ribonuclease H-related protein  55 
 
 		 97 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  55.26 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  25.52 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3803  hypothetical protein  32.78 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353576  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  28.49 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  27.61 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  53.85 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  24.81 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  22.39 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3186  ribonuclease H  47.27 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  51.28 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  21.18 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09202  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01860  hypothetical protein  39.58 
 
 		 553 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.948924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  25 
 
 		 192 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  23.05 
 
 		 262 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>