21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00291 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00291  ribonuclease H-related protein  100 
 
 		 97 aa  199  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  50 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  45.83 
 
 		 210 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  53.06 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  46.94 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  55 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  46.67 
 
 		 209 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  44.19 
 
 		 212 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  51.28 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  35.06 
 
 		 321 aa  45.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  48.72 
 
 		 463 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  43.18 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  40.38 
 
 		 321 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  43.59 
 
 		 222 aa  43.5  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  48.48 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  37.78 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  42.5 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  39.53 
 
 		 211 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  34.94 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  38 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  41.03 
 
 		 201 aa  40  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>