49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl475 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  47.32 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  40.8 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  38.5 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  38.97 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  38.27 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  38.31 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  33.81 
 
 		 487 aa  122  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  35.96 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  35.47 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  33.66 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  33.99 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  32.02 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  27.27 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  33.85 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  26.69 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  30.65 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  25.21 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  41.1 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  56.52 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  32.95 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  26.09 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  31.25 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  29.28 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  28.99 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  38.71 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  23.68 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  40.3 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  46.81 
 
 		 463 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  48.78 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  48.78 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84962  predicted protein  43.48 
 
 		 289 aa  48.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.536372  normal  0.854998 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  45.24 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  28.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  35.21 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  24.45 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  33.77 
 
 		 691 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  30.28 
 
 		 159 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  23.08 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  26.21 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  47.62 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  27.86 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  27.27 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01860  hypothetical protein  29.58 
 
 		 553 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.948924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  26.76 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  30.69 
 
 		 210 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  23.05 
 
 		 272 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  22.7 
 
 		 215 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  41.86 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>