More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03470 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  100 
 
 		 321 aa  664    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  36.88 
 
 		 463 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0297  ribonuclease HI  39.1 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1751  ribonuclease HI  45.1 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4263  ribonuclease H  37.33 
 
 		 162 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000698062  hitchhiker  0.0000000000000553912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  29.96 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  28.73 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  40.27 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  28.09 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  24.81 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  44.95 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  30.07 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  38.61 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  37.58 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84962  predicted protein  36.08 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.536372  normal  0.854998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  26.49 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  32.21 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  37.09 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3186  ribonuclease H  26.91 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  37.09 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  28.21 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  44.25 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  36.05 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  36.54 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  35.43 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  31.18 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  28.41 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  37.61 
 
 		 149 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  35.19 
 
 		 151 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  35.29 
 
 		 146 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  34.64 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  36.84 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  34.38 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  43.27 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  37.97 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  43.27 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  35.62 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  37.32 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  42.72 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  35.37 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  36 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  36.05 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  34.32 
 
 		 527 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  34.19 
 
 		 161 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  36 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  27.34 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  25 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  36.24 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  33.55 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  35.33 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  35.58 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  34.23 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  32.89 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  30.72 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  33.11 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  34.87 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.14 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  37.09 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  35.71 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  34.44 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  33.55 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  35.57 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  33.78 
 
 		 145 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  34.67 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  34.87 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  31.72 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  38.67 
 
 		 143 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  34.59 
 
 		 157 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  34.25 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  33.56 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  40.38 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  35.37 
 
 		 142 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  40.71 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  35.67 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  34.9 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  35.57 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  36.67 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  34.48 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  38.61 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  34.67 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  28.84 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  34.44 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  34.18 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  38.19 
 
 		 149 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  34.9 
 
 		 148 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  34.62 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  34.69 
 
 		 152 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  36.42 
 
 		 149 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  34.9 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  34.9 
 
 		 148 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  36.18 
 
 		 147 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  35.42 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  31.29 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  32.21 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  34.81 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  35.81 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  34.69 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  34.69 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  34.69 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  36 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>