40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2542 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  54.76 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  47.47 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  48.34 
 
 		 211 aa  211  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  47.91 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  46.49 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  47.56 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3161  hypothetical protein  41.06 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  29.33 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  26.87 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  32.18 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  35.17 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  33.1 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3186  ribonuclease H  31.03 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  29.81 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  28.37 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  28.57 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  33.33 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  25.52 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  29.48 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  58.14 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  30.59 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  58.14 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  55.81 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  27.57 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  56.1 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00291  ribonuclease H-related protein  50 
 
 		 97 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  28.76 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  53.49 
 
 		 691 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  48.78 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  26.32 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  41.3 
 
 		 463 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  40.74 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  45.24 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  41.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  46.51 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  43.48 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  32.89 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  41.86 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  30.26 
 
 		 159 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>