78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1436 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  97.13 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  41.38 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  39.41 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  38.42 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  38.35 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  35.75 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  35.61 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  36.84 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  35.47 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  32.72 
 
 		 487 aa  108  5e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  36.92 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  32.85 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  40.43 
 
 		 754 aa  95.9  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  40 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  36.03 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  28.87 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  28.99 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  26.5 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  27.86 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  24.14 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  39.13 
 
 		 376 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  24.52 
 
 		 272 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  28.95 
 
 		 158 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  28.76 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  25.53 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  27.59 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  28.76 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  28.76 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  29.53 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  28.76 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  26.18 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  28.95 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  28.95 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  25.34 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  28.76 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  29.17 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  25 
 
 		 153 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  25.42 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  27.63 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  26.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  27.21 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  27.74 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  25.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  25.17 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  26.9 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  21.52 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  26.49 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  30 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  25.73 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  33.33 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  27.03 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  25.52 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  27.21 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  29.33 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  28.08 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  26.35 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  27.4 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  24.91 
 
 		 321 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  28.19 
 
 		 480 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  25.17 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  28.67 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  22.38 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  27.59 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  29.53 
 
 		 154 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  28.67 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0706  ribonuclease H  25.83 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.572232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  25.87 
 
 		 146 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  24.66 
 
 		 156 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  25.32 
 
 		 153 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  25.69 
 
 		 153 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  27.45 
 
 		 148 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  27.45 
 
 		 148 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4905  ribonuclease H  24.68 
 
 		 154 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0317  Ribonuclease H  28.66 
 
 		 163 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  25 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  25.53 
 
 		 143 aa  41.2  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  31.58 
 
 		 151 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>