52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1703 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  97.13 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  41.87 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  39.41 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  38.42 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  38.35 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  36.54 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  35.61 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  33.18 
 
 		 487 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  36.84 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  35.96 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  36.45 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  32.69 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  40.43 
 
 		 754 aa  96.3  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  40 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  36.03 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  28.45 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  28.99 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  24.36 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  39.13 
 
 		 376 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  27.14 
 
 		 157 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  23.81 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  28.29 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  28.1 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  28.86 
 
 		 146 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  28.1 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  28.1 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  28.1 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  26.9 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  28.29 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  25.65 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  28.29 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  25.27 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  24.11 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  28.1 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  25 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  32.39 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  21.52 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  33.33 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  28.57 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  24.66 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  26.97 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  23.75 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0706  ribonuclease H  25.83 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.572232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  26.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  26.53 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  27.01 
 
 		 147 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  21.38 
 
 		 463 aa  42  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  40.43 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  24.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  23 
 
 		 321 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  38.1 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>