52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0717 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  37.7 
 
 		 754 aa  147  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  47.69 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  40 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  40 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  43.85 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  44.44 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  35.33 
 
 		 487 aa  89  5e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  42.31 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  37.12 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  38.19 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  37.32 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  39.71 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  33.85 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  35.1 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  31.82 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  30.23 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  31.33 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  30.82 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  26.88 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  28.86 
 
 		 146 aa  48.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  28.68 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  28.66 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  31.72 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  27.85 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  30.6 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  25.52 
 
 		 148 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  32.64 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  25.57 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  30.14 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  29.37 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  24.19 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  30.14 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  25.95 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  25.52 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  29.17 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  26.03 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  25.57 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  27.1 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  25.57 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  25.27 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  27.7 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  30 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  25.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  25.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  28.95 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  31.69 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  27.15 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  25.57 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  30.13 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  28.38 
 
 		 153 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>