20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0558 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  100 
 
 		 152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  57.04 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  36.03 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  36.03 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  33.33 
 
 		 754 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  31.82 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  31.82 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  28.36 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  26.09 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  28.89 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  29.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  29.41 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  28.36 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  30.82 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  24.81 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  25.56 
 
 		 487 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  24.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  25.38 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  31.69 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  26.24 
 
 		 173 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>