44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1536 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  45.36 
 
 		 221 aa  157  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  44.72 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  44.72 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  43.22 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  42.86 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  40.8 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  41.24 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  38.28 
 
 		 487 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  41.87 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  41.38 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  40.58 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  36.22 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  40.51 
 
 		 754 aa  93.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  44.44 
 
 		 220 aa  91.7  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  55.77 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  31.82 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  43.66 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  24.46 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  26.67 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  26.32 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  46.15 
 
 		 463 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84962  predicted protein  50 
 
 		 289 aa  52  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.536372  normal  0.854998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  32.17 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  44.68 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  29.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  28.26 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  34.48 
 
 		 321 aa  48.5  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  43.14 
 
 		 376 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  24.14 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  25.89 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  51.22 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  41.3 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0604  ribonuclease H  31.69 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  27.01 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  43.48 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  36 
 
 		 691 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  25.19 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  48.57 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  27.32 
 
 		 263 aa  42  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  41.51 
 
 		 251 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  27.07 
 
 		 254 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  26.47 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>