34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2423 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  56.46 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  49.77 
 
 		 212 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  51.64 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  50.71 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  47.09 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  46.49 
 
 		 215 aa  195  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3161  hypothetical protein  40.27 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  25.84 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  30 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  31.31 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  30.67 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  40.62 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3186  ribonuclease H  32.32 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  48.78 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  48.89 
 
 		 487 aa  48.5  0.00006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  29.74 
 
 		 254 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  28.4 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  25.54 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  51.22 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  52.78 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  27.61 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  24.14 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  27.68 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  23.94 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  29.88 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00291  ribonuclease H-related protein  43.18 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  44.74 
 
 		 463 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  25.54 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  45.24 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  45.24 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  45.24 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  40.38 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>