153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0505 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  92.9 
 
 		 466 aa  868    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 470 aa  960    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  62.26 
 
 		 466 aa  624  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  64.3 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  61.72 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  62.8 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  53.42 
 
 		 480 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  53 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  51.35 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  50.31 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  48.96 
 
 		 474 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  44.87 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  45.97 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  44.89 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  44.14 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 		 453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  31.98 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.14 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  27.41 
 
 		 441 aa  150  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  29.61 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  27.6 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  26.17 
 
 		 439 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  27.29 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  26.87 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  27.45 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  26.39 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  27.43 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  27.97 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  27.71 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  26.6 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  25.27 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 457 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  27.33 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  26.71 
 
 		 441 aa  124  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  25.7 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25.87 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  24.36 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  26.29 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  26.6 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  23.93 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  25.21 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  25.96 
 
 		 462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  24.11 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  25.81 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  26.77 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  26.77 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  26.51 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.22 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  26.77 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  26.51 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  26.24 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25.81 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25.81 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  26.24 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  25.48 
 
 		 446 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  26.02 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  25.81 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  25.82 
 
 		 441 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  25.59 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  23.08 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  23.85 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  25.06 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  23.2 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 466 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  25.85 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  25.58 
 
 		 416 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  26.17 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  25.92 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  26.48 
 
 		 447 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  24.8 
 
 		 452 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  23.77 
 
 		 488 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  22.57 
 
 		 440 aa  93.2  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  23.97 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  22.39 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  25.34 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  24.75 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  26.57 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  25.53 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  27.16 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  27.98 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  23.57 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>