150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2449 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
453 aa  946    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  41.98 
 
 
452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  42.29 
 
 
480 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  42.71 
 
 
480 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  41.98 
 
 
484 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  43.96 
 
 
460 aa  382  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  40.83 
 
 
480 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  41.61 
 
 
463 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  38.14 
 
 
466 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  39.17 
 
 
448 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  38.18 
 
 
464 aa  323  5e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  40.6 
 
 
466 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 
474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 
471 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  37.92 
 
 
469 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  36.54 
 
 
461 aa  292  7e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  36.77 
 
 
472 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.6 
 
 
447 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  28.12 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  28.1 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  27.03 
 
 
438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.49 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  27.17 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
468 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.89 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 
426 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
468 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  28.03 
 
 
439 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  28.28 
 
 
443 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  26.14 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  26.32 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  23.75 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  26.55 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  25.33 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 
436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  25.45 
 
 
435 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  24.94 
 
 
440 aa  114  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  25.44 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  24.89 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  25.05 
 
 
441 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
457 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.02 
 
 
440 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
440 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
424 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  25.55 
 
 
441 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  25.22 
 
 
441 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 
441 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  24.3 
 
 
489 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  25.33 
 
 
441 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  25.33 
 
 
441 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  26.37 
 
 
475 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 
474 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25.76 
 
 
438 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  25.33 
 
 
441 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  25.33 
 
 
441 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  25.33 
 
 
441 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  25.33 
 
 
441 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  25.49 
 
 
451 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  24.55 
 
 
440 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  25.33 
 
 
441 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  24.24 
 
 
438 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  25.27 
 
 
451 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  25.27 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  25.27 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  25.27 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 
439 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  25.11 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  23.83 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  24.12 
 
 
460 aa  97.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  22.2 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  25.06 
 
 
450 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  23.37 
 
 
456 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  25.06 
 
 
450 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  25.43 
 
 
450 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  24.94 
 
 
450 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  25.06 
 
 
450 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 
424 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  24.94 
 
 
450 aa  94  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  23.96 
 
 
436 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  25.06 
 
 
450 aa  94  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  23.37 
 
 
456 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  24.81 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  24.75 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  25.84 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  23.44 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  26.05 
 
 
460 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  24.56 
 
 
441 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  23.44 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  23.44 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
440 aa  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  22.99 
 
 
451 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  22.99 
 
 
451 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
435 aa  90.1  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  23.23 
 
 
451 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  22.91 
 
 
487 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>