153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1959 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
448 aa  925    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  39.17 
 
 
453 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  36.98 
 
 
452 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  36.33 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 
480 aa  312  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  36.46 
 
 
460 aa  297  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  33.89 
 
 
480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  34.77 
 
 
484 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 
464 aa  278  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  33.33 
 
 
463 aa  266  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 
461 aa  262  8e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 
474 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 
466 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  31.98 
 
 
470 aa  239  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  30.06 
 
 
466 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  32.27 
 
 
472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  29.18 
 
 
441 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  30.63 
 
 
443 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.7 
 
 
435 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  30.29 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  31.25 
 
 
447 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 
426 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  28.6 
 
 
462 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  28.6 
 
 
430 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  26.39 
 
 
439 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  25.93 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  26.62 
 
 
449 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  27.5 
 
 
426 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  26.7 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  27.17 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  27.05 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 
468 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  25.88 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 
457 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
435 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  25.82 
 
 
456 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 
437 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
474 aa  131  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  26.45 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.29 
 
 
432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  25.11 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  28.26 
 
 
446 aa  130  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 
453 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  23.08 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 
435 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 
438 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  25.87 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  25.87 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  25.87 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  25.62 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  25.77 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  26.98 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25.87 
 
 
451 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25.87 
 
 
451 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  27.19 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  25.37 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  26.55 
 
 
488 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  27.16 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
436 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  23.57 
 
 
438 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  24.03 
 
 
451 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  25.39 
 
 
489 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 
440 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 
487 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  24.03 
 
 
451 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  24.03 
 
 
451 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.03 
 
 
451 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  23.31 
 
 
451 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  23.57 
 
 
440 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  23.86 
 
 
460 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  23.72 
 
 
441 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 
490 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  24.51 
 
 
463 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 
466 aa  99.8  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  25.53 
 
 
475 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  25.96 
 
 
441 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  25.93 
 
 
441 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  25.74 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  22.72 
 
 
436 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  24.28 
 
 
450 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  22.52 
 
 
440 aa  90.1  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  25.48 
 
 
441 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  25.65 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  25.43 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  25.43 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  25.43 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  22.96 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  23.98 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  25.28 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  25.28 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  25.38 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  25.28 
 
 
451 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  23.13 
 
 
447 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 
441 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>