153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2891 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 468 aa  970    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  94.22 
 
 		 468 aa  920    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  73 
 
 		 439 aa  708    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  72.4 
 
 		 449 aa  688    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  63.3 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  62.34 
 
 		 437 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  63.25 
 
 		 441 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  57.77 
 
 		 438 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  57.51 
 
 		 438 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  56.58 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  56.07 
 
 		 456 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  55.86 
 
 		 456 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  55.23 
 
 		 453 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  54.58 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  54.58 
 
 		 451 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  54.58 
 
 		 451 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  54.58 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  54.58 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  54.79 
 
 		 451 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  54.79 
 
 		 451 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  54.58 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  52.92 
 
 		 451 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  52.92 
 
 		 451 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  52.92 
 
 		 451 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  52.92 
 
 		 451 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  54.29 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  53.33 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  50.32 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  50.64 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  50.32 
 
 		 438 aa  445  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  49.89 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  50.96 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  51.39 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  50.43 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  47.9 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  48.52 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  46.6 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  47 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  43.74 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  47.53 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  44.85 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  45.04 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  45.57 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 		 490 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  36.46 
 
 		 489 aa  280  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  35.67 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  35.67 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  34.9 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  35.43 
 
 		 447 aa  263  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  32.53 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 453 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  28.54 
 
 		 475 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  29.21 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  27.72 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  25.71 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  26.43 
 
 		 476 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  28.96 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  24.79 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  26.52 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  24.58 
 
 		 448 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  26.55 
 
 		 436 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  25.77 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  26.91 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  27.12 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  26.91 
 
 		 441 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  26.91 
 
 		 441 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  26.91 
 
 		 441 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  26.91 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.32 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  26.91 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  26.69 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  25 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  23.98 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.11 
 
 		 442 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 		 480 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  24.95 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  23.55 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  24.9 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  22.91 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  23.81 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  25.31 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 435 aa  118  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  25.63 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  24.27 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  26.47 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  31.98 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 466 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  25.36 
 
 		 451 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  26.62 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>