153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1002 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 		 489 aa  1017    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  56.56 
 
 		 490 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  56.91 
 
 		 488 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  56.91 
 
 		 488 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  56.15 
 
 		 490 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  40.86 
 
 		 441 aa  338  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  42.47 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  40.09 
 
 		 439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  38.04 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  37.13 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  37.14 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  37.67 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  37.02 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  37.56 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  35.93 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  36.46 
 
 		 468 aa  280  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  34.68 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  37.22 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  35.81 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  36.61 
 
 		 438 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  35.37 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  33.98 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  33.94 
 
 		 430 aa  253  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  34.22 
 
 		 453 aa  250  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  33.69 
 
 		 457 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  34.44 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  34.22 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  33.41 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  33.77 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  33.77 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  33.77 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 451 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  33.55 
 
 		 451 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 451 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 451 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  33.55 
 
 		 451 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  33.55 
 
 		 451 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  33.71 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  35.82 
 
 		 441 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  30.85 
 
 		 447 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  35.08 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  33.11 
 
 		 440 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  31.3 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  29.53 
 
 		 426 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  29.4 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  27.25 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  30.48 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  28.95 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  29.27 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  28.6 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  28.82 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  28.6 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  26.77 
 
 		 432 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  29.42 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  26.19 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  29.14 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  28.51 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  28.51 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 424 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  27.52 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  25.91 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  27.55 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.78 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.75 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  26.87 
 
 		 450 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  26.87 
 
 		 450 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  26.87 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  27.31 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  26.86 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  26.05 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 		 450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  26.05 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  24.22 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  26.65 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  24.83 
 
 		 460 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  26.7 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>