153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1245 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 		 446 aa  920    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  65.54 
 
 		 453 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  65.1 
 
 		 457 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  64.21 
 
 		 456 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  63.76 
 
 		 456 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  58.24 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  58.47 
 
 		 451 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  58.24 
 
 		 451 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  58.24 
 
 		 451 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  58.24 
 
 		 451 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  58.01 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  58.01 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  58.24 
 
 		 451 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  57.75 
 
 		 451 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  57.53 
 
 		 451 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  57.75 
 
 		 451 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  57.75 
 
 		 451 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  57.53 
 
 		 451 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  55.63 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  54.65 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  50.53 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  50.32 
 
 		 468 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  50.56 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  51.37 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  49.55 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  49.21 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  48.63 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  46.24 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  47.98 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  48.54 
 
 		 438 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  46.05 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  46.53 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  46.71 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  46.61 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  43.57 
 
 		 439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  40.27 
 
 		 441 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  41.08 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  41.96 
 
 		 462 aa  339  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  40.22 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  39.64 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  40.91 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  44.09 
 
 		 443 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  36.5 
 
 		 441 aa  302  8.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  33.93 
 
 		 447 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  31.3 
 
 		 489 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  32.46 
 
 		 488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 490 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  31.81 
 
 		 488 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  30.67 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  28.51 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  30.95 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  29.18 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  31.04 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  28.42 
 
 		 474 aa  169  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  26.9 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  23.99 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  24.78 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  28.19 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 466 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  25.92 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  24.61 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  28.26 
 
 		 448 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  25.65 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 424 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  28.72 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  28.07 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.77 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  24.63 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  23.54 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  34.47 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  23.86 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  25.12 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  24.84 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  24.41 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  23.48 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  27.73 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  22.08 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  22.96 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  22.08 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  23.58 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  28.84 
 
 		 440 aa  100  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  21.85 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  24.4 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  22.88 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  21.85 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  21.81 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  22.61 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  22.83 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>