149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0175 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  95.54 
 
 		 471 aa  939    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 469 aa  974    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  67.81 
 
 		 466 aa  659    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  62.8 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  62.8 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  55.36 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  47.25 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 		 480 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  45.17 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  42.71 
 
 		 452 aa  352  8.999999999999999e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  41.6 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  41.86 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  39.83 
 
 		 460 aa  331  1e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  39.63 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  37.92 
 
 		 453 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  30.08 
 
 		 448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  26.78 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  28.19 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  26.13 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  25.42 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  24.47 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  23.38 
 
 		 449 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  25.42 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  23.84 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 		 432 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  24.78 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  26.41 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  24.46 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  25.64 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  23.8 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  25.49 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  24.63 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  24.58 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  24.68 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  23.97 
 
 		 489 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  24.89 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  24.94 
 
 		 416 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.7 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  23.88 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  25.97 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  25.97 
 
 		 451 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  24.18 
 
 		 460 aa  96.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  25.59 
 
 		 438 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 468 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  25.97 
 
 		 451 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 451 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  25.97 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  25.69 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  25.97 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25.76 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 424 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25.76 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  25.27 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  25.27 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  24.35 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  24.84 
 
 		 451 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.84 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  24.22 
 
 		 488 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  22.76 
 
 		 490 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  24.62 
 
 		 432 aa  94  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  23.54 
 
 		 474 aa  93.2  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  25.21 
 
 		 451 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  23.39 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  27.5 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  23.8 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  22.92 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  26.21 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  24.44 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 487 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  23.31 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  22.25 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  20.26 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  27.04 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  22.03 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  23.96 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  23.36 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  23.45 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  21.69 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  23.11 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  22.93 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  23.54 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  23.75 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  23.53 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  24.53 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>