150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0127 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  64.05 
 
 
480 aa  656    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
484 aa  1000    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  63.64 
 
 
480 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  59.3 
 
 
480 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  57.56 
 
 
474 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  49.28 
 
 
466 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  51.35 
 
 
470 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  48.07 
 
 
471 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  48.25 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  47.25 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 
472 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  44.65 
 
 
460 aa  418  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  43.15 
 
 
464 aa  404  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  41.98 
 
 
453 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  43.53 
 
 
452 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 
461 aa  349  8e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  34.77 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.24 
 
 
447 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.74 
 
 
441 aa  143  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  25.26 
 
 
438 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  26.06 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  24.68 
 
 
441 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  24.12 
 
 
439 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.8 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  23.25 
 
 
432 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  23.98 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  25.06 
 
 
443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  22.64 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  22.45 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  25.05 
 
 
489 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  25.05 
 
 
426 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  23.14 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.66 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  22.48 
 
 
432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 
426 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  22.63 
 
 
460 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  23.09 
 
 
438 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  24.21 
 
 
439 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
466 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  24.43 
 
 
440 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  23.27 
 
 
438 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  23.12 
 
 
441 aa  100  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  23.8 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  21.96 
 
 
490 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  24.95 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  24.95 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  22.92 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  22.36 
 
 
430 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 
435 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  24.48 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.48 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  23 
 
 
435 aa  96.7  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  22.88 
 
 
488 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 
440 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  22.44 
 
 
488 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 
474 aa  94.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  24.12 
 
 
451 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  24.18 
 
 
475 aa  93.6  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  22.06 
 
 
451 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  22.06 
 
 
451 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  22.18 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  22.18 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 
490 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  23.42 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  22.18 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  23.35 
 
 
476 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 
436 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
457 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  24.95 
 
 
441 aa  91.3  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  21.97 
 
 
451 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  22.38 
 
 
451 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  21.95 
 
 
451 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  22.27 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  25.82 
 
 
441 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  22.43 
 
 
463 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  24.54 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  24.9 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  23.37 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  21.56 
 
 
460 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  25.93 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  25.81 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  24.69 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  24.49 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  24.49 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  24.49 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  22.11 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  24.29 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  24.49 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  24.49 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  23.28 
 
 
416 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  23.6 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  22.68 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  27.35 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  25.91 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>