153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3396 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  73.06 
 
 		 487 aa  739    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 466 aa  970    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  55.1 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  52.53 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  50.65 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  40.81 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  40.65 
 
 		 476 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  39.01 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  38.1 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  30.97 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  28.87 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  29.04 
 
 		 435 aa  186  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  29.03 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  27.15 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  27.74 
 
 		 439 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  27.84 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  29.28 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  29.28 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  29.28 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  28.85 
 
 		 451 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  29.07 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  27.84 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  28.87 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  28.2 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  28.17 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  28.2 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  27.53 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  27.96 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  28.2 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  28.2 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  27.96 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  26.72 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  28.04 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  26.65 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  30.14 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  26.97 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  26.51 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  25.37 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  26.24 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  25.64 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  27.21 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  27.07 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  26.91 
 
 		 430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  26.3 
 
 		 446 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  26.71 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  25.86 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 474 aa  140  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  26.5 
 
 		 488 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  26.06 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  24.26 
 
 		 489 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  24.67 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  27.27 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  24.89 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  26.22 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  26.82 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  25.86 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  26.82 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  26.82 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  26.82 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  23.92 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  25.32 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  26.61 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  26.46 
 
 		 441 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  26.21 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  26.61 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  26.21 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  25.11 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  25.79 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  28.54 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 464 aa  106  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  25.31 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  24.12 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  24.42 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  23.35 
 
 		 448 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  22.27 
 
 		 460 aa  96.3  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  24.64 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  22.04 
 
 		 466 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 440 aa  95.1  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  24.58 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>