145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0765 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
474 aa  971    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  62.82 
 
 
480 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  62.82 
 
 
480 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  60.42 
 
 
480 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  57.56 
 
 
484 aa  561  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  53.55 
 
 
472 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  49.48 
 
 
471 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 
469 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  50.1 
 
 
466 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  48.96 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  47.91 
 
 
463 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  41.13 
 
 
460 aa  378  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 
464 aa  355  8.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  41.49 
 
 
452 aa  338  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  39.09 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 
453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  31.33 
 
 
448 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  26.69 
 
 
447 aa  156  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  26.95 
 
 
488 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  27.39 
 
 
488 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  26.15 
 
 
489 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  24.46 
 
 
435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  25.33 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  25.47 
 
 
438 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  25.22 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  23.52 
 
 
430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  26.37 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  23.23 
 
 
449 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  25.6 
 
 
443 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 
474 aa  107  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  25.16 
 
 
441 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  23.62 
 
 
439 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  21.51 
 
 
432 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  22.68 
 
 
468 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 
468 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  22.29 
 
 
432 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
438 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  23.21 
 
 
439 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  22.62 
 
 
439 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.55 
 
 
462 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  22.93 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 
437 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  23.81 
 
 
446 aa  90.1  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  22.53 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  22.93 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  24.17 
 
 
438 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  27.56 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 
487 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 
426 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  23.81 
 
 
460 aa  87  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
436 aa  86.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  23.33 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  22.5 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  24.7 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  23.88 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  22.37 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  20.63 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  24.39 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  21.09 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  21.09 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  23.3 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  23.52 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  23.43 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  21.78 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  24.57 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  24.57 
 
 
451 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  24.57 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  24.57 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  22.48 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  25.74 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  25.74 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  22.64 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  24.57 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  21.14 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  28.02 
 
 
451 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  21.82 
 
 
440 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  22.22 
 
 
440 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  28.02 
 
 
451 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  25.25 
 
 
451 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  21.03 
 
 
419 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  22.57 
 
 
452 aa  64.3  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  21.48 
 
 
475 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  21.96 
 
 
424 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  22.51 
 
 
460 aa  63.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  19.33 
 
 
422 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  23.84 
 
 
441 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  19.84 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  23.6 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  23.6 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  23.6 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>