153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3858 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
427 aa  857    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  40.65 
 
 
432 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  38.16 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  37.81 
 
 
437 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  37.81 
 
 
437 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  37.87 
 
 
433 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 
435 aa  262  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  34.02 
 
 
436 aa  259  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  35.99 
 
 
441 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
441 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  35.54 
 
 
441 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  35.76 
 
 
441 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  35.76 
 
 
441 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  35.54 
 
 
441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  35.54 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  35.54 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  35.54 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  35.54 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  35.31 
 
 
441 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  37.36 
 
 
422 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  35.16 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  33.33 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  33.79 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  38.21 
 
 
419 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  35.39 
 
 
440 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  35.16 
 
 
440 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  33.48 
 
 
436 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  33.11 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  32 
 
 
416 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 
424 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  33.41 
 
 
424 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  33.48 
 
 
453 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  32.6 
 
 
447 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  33.04 
 
 
455 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  31.58 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  30.37 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  31.35 
 
 
450 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 
415 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  35.91 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  31.12 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  31.12 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  31.12 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  31.35 
 
 
450 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  29.41 
 
 
442 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  31.12 
 
 
450 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  31.12 
 
 
450 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  31.12 
 
 
450 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  32.27 
 
 
451 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  30.89 
 
 
451 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  31.22 
 
 
451 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  30.89 
 
 
451 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
461 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  34.69 
 
 
460 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  29.15 
 
 
440 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  29.15 
 
 
440 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  29.08 
 
 
440 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.79 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.92 
 
 
440 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  29.19 
 
 
446 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  29.55 
 
 
442 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  28.51 
 
 
440 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  26.17 
 
 
459 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  31.55 
 
 
453 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  27.25 
 
 
442 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  27.97 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  34.51 
 
 
447 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.14 
 
 
485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  33.7 
 
 
457 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 
466 aa  166  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  32.44 
 
 
465 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  28.73 
 
 
435 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  27.77 
 
 
489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  26.76 
 
 
438 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  36.7 
 
 
461 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  29.8 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 
488 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  27.27 
 
 
441 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
490 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  24.66 
 
 
441 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 
488 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  28.79 
 
 
490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  27.43 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  27.96 
 
 
439 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  29.25 
 
 
435 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  28.48 
 
 
439 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 
426 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  28.79 
 
 
462 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  32.1 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  27.21 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.4 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  26.85 
 
 
452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  27.41 
 
 
441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 
457 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  28.05 
 
 
475 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  26.97 
 
 
451 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  26.97 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>