149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0970 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
480 aa  984    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  64.05 
 
 
484 aa  656    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  77.5 
 
 
480 aa  794    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  98.96 
 
 
480 aa  978    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  62.82 
 
 
474 aa  620  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 
472 aa  504  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  51.97 
 
 
463 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  52.8 
 
 
466 aa  485  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  53 
 
 
470 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  48.54 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 
469 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  45.55 
 
 
460 aa  431  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  47.51 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  42.29 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  44.72 
 
 
464 aa  395  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  41.16 
 
 
461 aa  352  7e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  36.33 
 
 
448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  26.96 
 
 
447 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  28.27 
 
 
441 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  28.27 
 
 
438 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  26.83 
 
 
435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  24.63 
 
 
435 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 
468 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  25.69 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  25.72 
 
 
443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  25.16 
 
 
432 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.69 
 
 
432 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 
487 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  25.21 
 
 
439 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  26.27 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  23.68 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  24.31 
 
 
488 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  24.52 
 
 
490 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  25.92 
 
 
439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  26.28 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  30.57 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  24.15 
 
 
488 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 
468 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  24.9 
 
 
475 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  25.47 
 
 
452 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  28.52 
 
 
432 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 
435 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25.37 
 
 
438 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 
436 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  23.42 
 
 
453 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  31.65 
 
 
462 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 
424 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  24.95 
 
 
427 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  23.37 
 
 
441 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 
490 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  24.68 
 
 
440 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  26 
 
 
474 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  22.62 
 
 
457 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  24.32 
 
 
430 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  24.06 
 
 
476 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 
474 aa  97.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  25.67 
 
 
485 aa  96.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 
435 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  23.22 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  27.05 
 
 
456 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  23.98 
 
 
463 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  27.05 
 
 
456 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  22.48 
 
 
440 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.27 
 
 
451 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  23.48 
 
 
451 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  23.64 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  23.64 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  22.7 
 
 
430 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  23.53 
 
 
441 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  23.8 
 
 
451 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  22.2 
 
 
453 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  22.01 
 
 
446 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 
424 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  22.88 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 
440 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  22.88 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  22.88 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  22.88 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  22.49 
 
 
451 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  22.49 
 
 
451 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  22.61 
 
 
451 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  22.66 
 
 
451 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  23.74 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  22.78 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  22.78 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  23.42 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  23.84 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  22.57 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  22.57 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  22.57 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  22.57 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  22.57 
 
 
450 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  22.57 
 
 
450 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  23.21 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  22.27 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>