153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1898 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  99.78 
 
 
450 aa  927    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  99.11 
 
 
450 aa  922    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  90.4 
 
 
451 aa  843    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  99.78 
 
 
450 aa  927    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  99.56 
 
 
450 aa  924    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  99.11 
 
 
450 aa  921    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
450 aa  929    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  99.11 
 
 
450 aa  920    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  90.89 
 
 
451 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  90.67 
 
 
451 aa  854    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  91.33 
 
 
451 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  91.11 
 
 
451 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  90.89 
 
 
451 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  99.56 
 
 
450 aa  924    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  53.3 
 
 
447 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  52.18 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  51.95 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  52.18 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  51.72 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 
441 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  51.72 
 
 
441 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  46.78 
 
 
468 aa  425  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  47.85 
 
 
436 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  47.61 
 
 
441 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  44.87 
 
 
436 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  44.6 
 
 
440 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  43.05 
 
 
440 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  43.02 
 
 
440 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  42.76 
 
 
440 aa  352  7e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  44.06 
 
 
435 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  42.95 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  42.95 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  42.01 
 
 
433 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 
424 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  37.99 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  38.39 
 
 
416 aa  272  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  34.64 
 
 
419 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  33.03 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  33.94 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  33.26 
 
 
415 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  33.56 
 
 
415 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  31.35 
 
 
427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  31 
 
 
460 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  29.82 
 
 
410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  29.83 
 
 
453 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 
440 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  30.24 
 
 
460 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  29 
 
 
485 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  27.27 
 
 
442 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  29.44 
 
 
447 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  29.98 
 
 
453 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  27.17 
 
 
442 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0536804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  26.61 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  26.61 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.61 
 
 
440 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.83 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.39 
 
 
440 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 
455 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 
440 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  26.64 
 
 
459 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  25.88 
 
 
442 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
466 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  26.23 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.37 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  28.64 
 
 
457 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  27.8 
 
 
438 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.67 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  32.52 
 
 
461 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  27.54 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  26.43 
 
 
465 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  26.56 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.5 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  26.87 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  27.17 
 
 
488 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  26.3 
 
 
439 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  26.94 
 
 
490 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  25.7 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  25.7 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  25.7 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  25.7 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  25.7 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25.7 
 
 
451 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25.7 
 
 
451 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  26.3 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.39 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  25.22 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  24.78 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  25.88 
 
 
449 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.78 
 
 
451 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  26.74 
 
 
438 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  25.16 
 
 
462 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>