153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0241 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  100 
 
 		 437 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  77.03 
 
 		 433 aa  686    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  84.37 
 
 		 435 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 437 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  56.94 
 
 		 440 aa  511  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  55.76 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  56.35 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  50.92 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  51.83 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  52.51 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  51.83 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  51.6 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  51.83 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  51.6 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  51.6 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  52.52 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  51.6 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  51.6 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  51.37 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  51.14 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  49.2 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  45.77 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  47.95 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  45.61 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  42.95 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  42.73 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  42.73 
 
 		 451 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  44.78 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  43.18 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  42.6 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  42.95 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  42.73 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  42.73 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  43.18 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  43.18 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  43.18 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  43.18 
 
 		 450 aa  345  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  42.95 
 
 		 450 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  42.95 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  43.39 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  40.74 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  43.39 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  41.26 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 		 415 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  37.1 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  34.79 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  35.33 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  33.81 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  32 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  28.72 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  31.9 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  32.05 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  31.73 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  29.05 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  33.41 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  30.6 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  26.75 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 466 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  27.27 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  28.26 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  28.26 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.16 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.26 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.04 
 
 		 440 aa  183  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.04 
 
 		 440 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  26.67 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  31.43 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.48 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  28.7 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.17 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  28 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  26.93 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  26.7 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  24.89 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  25.38 
 
 		 439 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  27.93 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  26.88 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  24.29 
 
 		 441 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  26.34 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  25.22 
 
 		 489 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  24.68 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  25.61 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  26.06 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  25.37 
 
 		 488 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  25.05 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  27.64 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  24.03 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  26.16 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>