153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0769 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 440 aa  915    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  71.88 
 
 		 441 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  64.55 
 
 		 435 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  64.55 
 
 		 432 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  59.09 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  53.35 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  51.45 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  51.01 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  47.9 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  50 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  48 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  47.27 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  47.87 
 
 		 456 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  47.98 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  49.44 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  49.66 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  49.66 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  49.66 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  49.66 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  49.66 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  49.11 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  49.11 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  47.65 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  49.66 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  49.66 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  48.67 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  48.89 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  48.89 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  49.66 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  48.31 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  47.36 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  45.41 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  43.64 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  42.07 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  43.78 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  43.15 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  42.73 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  42.34 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  40.77 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  39.78 
 
 		 441 aa  310  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  40.4 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  39.05 
 
 		 462 aa  300  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  41.67 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  33.48 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  33.11 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  33.26 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  33.11 
 
 		 488 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  33.04 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  32.74 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  33.1 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  27.8 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  27.89 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  29.78 
 
 		 452 aa  170  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  27.65 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  28.6 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  27.16 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  27.83 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  28.16 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 		 487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  30.84 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  29.96 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  30.62 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  29.39 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  30.4 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  26.59 
 
 		 452 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  30.4 
 
 		 441 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  30.4 
 
 		 441 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  30.4 
 
 		 441 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  29.96 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  30.18 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  29.96 
 
 		 441 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  26.68 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  27.68 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  28.02 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.39 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  27.04 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  25.68 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  25.68 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 440 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  26.83 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  27.72 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.18 
 
 		 440 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.18 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  27.62 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  26.69 
 
 		 468 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  25.75 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  27.21 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  26.39 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  24.89 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  26.42 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  27.07 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.17 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>