153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  100 
 
 		 435 aa  881    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  58.33 
 
 		 443 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  55.22 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  54.52 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  53.02 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  49.09 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  47.53 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  47.53 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  46.97 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  45.75 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  44.75 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  45.14 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  43.94 
 
 		 438 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  43.16 
 
 		 432 aa  348  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  43.75 
 
 		 432 aa  348  9e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  43.33 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  43.53 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  43.68 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  38.39 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  42.02 
 
 		 451 aa  332  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  42.02 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  42.02 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  42.02 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  42.02 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  42.02 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  42.02 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  43.38 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  42.02 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  41.12 
 
 		 451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  41.12 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  41.12 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  41.12 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  41.12 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  40.4 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  41 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  40.36 
 
 		 453 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  41.4 
 
 		 456 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  40.91 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  42.01 
 
 		 435 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  40.86 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  40.77 
 
 		 440 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  40.86 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  35.93 
 
 		 489 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  40.41 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  36.07 
 
 		 490 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  35.32 
 
 		 490 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  35.99 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  35.24 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  32.86 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  30.16 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  29.04 
 
 		 466 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  31.35 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  27.7 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  30.47 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  29.03 
 
 		 476 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  29.23 
 
 		 474 aa  176  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  26.1 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  29.68 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  29.52 
 
 		 485 aa  169  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  30.7 
 
 		 448 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  29.55 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 436 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  28.51 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  28.95 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  27.49 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  30.04 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  30.04 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 441 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  29.5 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  26.44 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  29.6 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  26.22 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  27.87 
 
 		 440 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  28.6 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  26.46 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  27.93 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 480 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  26.46 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  27.07 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  28.99 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  29.58 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  30.2 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>