154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0384 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
441 aa  905    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  46.31 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  43.74 
 
 
468 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  44.33 
 
 
468 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  45.23 
 
 
449 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  44.8 
 
 
435 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  42.86 
 
 
439 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 
474 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  43.18 
 
 
438 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  43.41 
 
 
432 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  42.76 
 
 
430 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  43.5 
 
 
441 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  42.28 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  42.31 
 
 
430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  41.82 
 
 
439 aa  355  5.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  43.62 
 
 
438 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  38.39 
 
 
435 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  41.04 
 
 
432 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  42.07 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  42.6 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  40.63 
 
 
437 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
435 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  39.04 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  40.18 
 
 
441 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  37.34 
 
 
451 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  37.34 
 
 
451 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  38.73 
 
 
456 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  38.07 
 
 
457 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  37.12 
 
 
451 aa  316  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  37.12 
 
 
451 aa  316  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  38.51 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  36.9 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  36.9 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  36.9 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  36.9 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  38.46 
 
 
443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  36.38 
 
 
451 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  36.38 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  36.38 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  36.38 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  36.17 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  36.5 
 
 
446 aa  302  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  36.84 
 
 
462 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  34.68 
 
 
489 aa  272  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  34.45 
 
 
490 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  33.63 
 
 
488 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  32.96 
 
 
488 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
490 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  33.71 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  30.63 
 
 
426 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  28.39 
 
 
463 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  26.77 
 
 
460 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  27.29 
 
 
476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 
487 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  26.02 
 
 
475 aa  163  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.64 
 
 
474 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
466 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  28.14 
 
 
452 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 
435 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  27.13 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  27.07 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
424 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 
424 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  27.67 
 
 
441 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  27.59 
 
 
447 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  28.99 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  26.15 
 
 
452 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  26.16 
 
 
440 aa  136  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  24.94 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  26.55 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  23.91 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  24.25 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  27.09 
 
 
441 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 
441 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 
441 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  26.87 
 
 
441 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  26.22 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  26.65 
 
 
441 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  26.65 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  26.65 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  26.71 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  26.65 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  24.29 
 
 
437 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
437 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  24.16 
 
 
460 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  24.22 
 
 
427 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  24.82 
 
 
410 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  25.22 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  25.93 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  23.08 
 
 
448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
484 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  25.31 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  23.92 
 
 
459 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>