153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2523 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
453 aa  934    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  53.64 
 
 
452 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  32.84 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
426 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  30.87 
 
 
426 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  31.15 
 
 
441 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  31.19 
 
 
432 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  28.75 
 
 
441 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  28.73 
 
 
438 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  28.69 
 
 
439 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  28.83 
 
 
438 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 
468 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  29.48 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  30.07 
 
 
430 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  32.95 
 
 
430 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  29.45 
 
 
435 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  28.63 
 
 
439 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  29.32 
 
 
453 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  26.54 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  26.54 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  26.69 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  26.69 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  26.69 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  26.69 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  26.69 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  28.2 
 
 
439 aa  173  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  28.96 
 
 
462 aa  173  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
437 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  25.9 
 
 
451 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  25.9 
 
 
451 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  28.48 
 
 
441 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  25.69 
 
 
451 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  26.11 
 
 
451 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  25.69 
 
 
451 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  28.38 
 
 
432 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  27.62 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  26.55 
 
 
449 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  27.67 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  26.98 
 
 
456 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  28.21 
 
 
435 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
457 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
435 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  28.22 
 
 
443 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 
440 aa  150  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 
490 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  28.42 
 
 
488 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  25.68 
 
 
476 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  27.47 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  26.33 
 
 
441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  25.05 
 
 
489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  27.96 
 
 
488 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  25.42 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  25.26 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 
487 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 
466 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  25.06 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.43 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  26.52 
 
 
432 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  26.46 
 
 
448 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  25.33 
 
 
452 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  26.68 
 
 
441 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  25.7 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  27.03 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  26.68 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  26.46 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  26.09 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  26.46 
 
 
441 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  26.46 
 
 
441 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  26.59 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  26.16 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  25.7 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  26.81 
 
 
441 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  24.47 
 
 
451 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  24.47 
 
 
451 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  25.92 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  34.98 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  36.14 
 
 
441 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 
441 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  24.84 
 
 
450 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
450 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  24 
 
 
451 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  24.62 
 
 
450 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  24.26 
 
 
451 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.77 
 
 
440 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
461 aa  107  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  24.26 
 
 
451 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  24.62 
 
 
450 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  25.32 
 
 
460 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  24.62 
 
 
450 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  24.62 
 
 
450 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  24.4 
 
 
450 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  24.4 
 
 
450 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  31.86 
 
 
440 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  23.74 
 
 
442 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  27.19 
 
 
468 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
442 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>