149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0177 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
471 aa  977    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  95.54 
 
 
469 aa  939    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  68.24 
 
 
466 aa  668    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  61.72 
 
 
470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  61.94 
 
 
466 aa  581  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  55.34 
 
 
463 aa  531  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  49.48 
 
 
474 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  48.07 
 
 
484 aa  474  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 
480 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  45.59 
 
 
480 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 
461 aa  354  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  39.92 
 
 
472 aa  348  9e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  41.05 
 
 
452 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  39.24 
 
 
460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  37.81 
 
 
464 aa  318  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 
453 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  28.9 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  26.45 
 
 
447 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  27.27 
 
 
435 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.31 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  26.47 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  24.74 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 
457 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 
437 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  24.41 
 
 
439 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  24.35 
 
 
449 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  24.41 
 
 
432 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  24.79 
 
 
441 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
435 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  26.39 
 
 
446 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  23.63 
 
 
440 aa  106  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  26.18 
 
 
430 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  24.26 
 
 
456 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  25.21 
 
 
437 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 
437 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  24.26 
 
 
456 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  24.58 
 
 
453 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  23.26 
 
 
432 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  24.49 
 
 
416 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 
436 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  24.62 
 
 
451 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25 
 
 
451 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  24.04 
 
 
453 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25 
 
 
451 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  24.62 
 
 
451 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  24.62 
 
 
451 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 
451 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  24.62 
 
 
451 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.81 
 
 
435 aa  96.3  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  24.62 
 
 
451 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  25.5 
 
 
447 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  24.69 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
468 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  23.61 
 
 
490 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  24.03 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  23.44 
 
 
489 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  24.14 
 
 
451 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
468 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  24.14 
 
 
451 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  24.14 
 
 
451 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.14 
 
 
451 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  23.04 
 
 
441 aa  94.4  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 
424 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  24.03 
 
 
441 aa  93.2  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  23.24 
 
 
460 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 
424 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  24.14 
 
 
451 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  24.74 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  22.25 
 
 
490 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  24.95 
 
 
430 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  24.84 
 
 
488 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  22.82 
 
 
432 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  26.73 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 
440 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  22.72 
 
 
487 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  24.41 
 
 
488 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  24.94 
 
 
439 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 
474 aa  87  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  23.73 
 
 
462 aa  86.7  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  22.64 
 
 
419 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  22.61 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  21.08 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  23.38 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25.43 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 
426 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  22.08 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  21.4 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  21.65 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  26.52 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  22.87 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  23.57 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  23.63 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  23.67 
 
 
468 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  22.57 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  22.33 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>