150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0988 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  98.96 
 
 		 480 aa  978    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  63.64 
 
 		 484 aa  654    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  76.88 
 
 		 480 aa  789    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 480 aa  983    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0765  glycoside hydrolase family protein  62.82 
 
 		 474 aa  620  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1352  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  52.17 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  53.21 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  53.42 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  48.54 
 
 		 466 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0175  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 		 469 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.949152  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  45.76 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  46.89 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  42.71 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  44.51 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  41.16 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  36.12 
 
 		 448 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  27.18 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  28.91 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  28.06 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  26.83 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  24.84 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  25.69 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  25.96 
 
 		 443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  25.16 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.9 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  25.64 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  26.48 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  23.89 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  24.74 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  24.95 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  24.58 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  31 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  26.16 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  25.64 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  29.07 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25.59 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  23.63 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 424 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  25.26 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  24.5 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.73 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  23.79 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  24.89 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  24.53 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  22.62 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.58 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  22.91 
 
 		 440 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 474 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  25.46 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  23.85 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  23.43 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  27.05 
 
 		 456 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.48 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  27.05 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  23.77 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  22.91 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  23.85 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  23.69 
 
 		 451 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  23.85 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  23.53 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  24.01 
 
 		 451 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  22.01 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  23.09 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  23.09 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  23.09 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  22.71 
 
 		 451 aa  87  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  22.71 
 
 		 451 aa  87  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  22.88 
 
 		 451 aa  87  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  22.83 
 
 		 451 aa  87  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  23.98 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  23.21 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  23.21 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  23.84 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  24.26 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  23 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  23 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  23 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  23 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  23 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  23 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  22.69 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  23.63 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>