More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2351 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2351  response regulator receiver protein  100 
 
 		 431 aa  827    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.13798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0660  response regulator receiver  50 
 
 		 620 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.528858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3149  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.45 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1193  diguanylate cyclase  42.99 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  35.54 
 
 		 139 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  36.36 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  37.19 
 
 		 125 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 265 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  34.35 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  40.19 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  35.54 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  34.35 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  34.35 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2466  diguanylate cyclase  42.2 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0503371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  33.74 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  35.54 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1203  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  35.54 
 
 		 209 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 265 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  37.07 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.52 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 471 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1613  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.17 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.057037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2855  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 415 aa  67  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220747  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1961  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 1057 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  39.57 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.65 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  37.38 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 128 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  40.94 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38278  predicted protein  38.26 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.81 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.61 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1038  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  38.02 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.61 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 1736 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.87 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 962 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  33.88 
 
 		 676 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2923  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  34.92 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 122 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0303  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.523171  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 939 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.73 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.53 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0985  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.758318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 756 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  40 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2726  two component response regulator  35.04 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 941 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 1137 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  38.05 
 
 		 593 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2642  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3850  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  40 
 
 		 919 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 1125 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 977 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 225 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 952 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 180 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 120 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.41 
 
 		 1152 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2335  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 831 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1016 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2681  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.818562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0161  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 129 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 180 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>