More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0660 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0660  response regulator receiver  100 
 
 		 620 aa  1181    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.528858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3149  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.19 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2351  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 431 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.13798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 2414 aa  77  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1613  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.83 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.057037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 756 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  41.53 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  41.53 
 
 		 121 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1203  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.5 
 
 		 2325 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 1155 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  42.99 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  41.6 
 
 		 128 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  35.19 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  35.94 
 
 		 1983 aa  70.5  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 1616 aa  70.5  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  38.05 
 
 		 1306 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  40.71 
 
 		 122 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 251 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 		 121 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  70.1  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  40 
 
 		 120 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 122 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  31.97 
 
 		 1020 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.26 
 
 		 974 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 1003 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.34 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  33.33 
 
 		 1378 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  37.19 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 		 124 aa  68.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.45 
 
 		 1197 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.13 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  36.8 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 2137 aa  67.8  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 122 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  40.52 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  38.18 
 
 		 242 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 887 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1193  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 415 aa  67  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 139 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 1012 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  36.45 
 
 		 420 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.85 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  35.16 
 
 		 1888 aa  66.6  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.82 
 
 		 311 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.82 
 
 		 311 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 1098 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 1098 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  37.5 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0166  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  33.94 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  37.29 
 
 		 121 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  35.38 
 
 		 2070 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  40.54 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  34.65 
 
 		 1970 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 941 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 130 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  39.81 
 
 		 768 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3464  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.61 
 
 		 704 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1961  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1057 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  32.81 
 
 		 1614 aa  65.1  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 137 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 121 aa  65.1  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  32.03 
 
 		 2092 aa  65.1  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 136 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>