More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0688 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0688  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.84 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  44.04 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  36.29 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  37.39 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  42.06 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  44.34 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  33.07 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  38.39 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.4 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  39.09 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  31.75 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  37.72 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  46.88 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  49.21 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  32.52 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  40.57 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  30.71 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  50.88 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  33.66 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  40.21 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  39.25 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  38.1 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  33.66 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  35.04 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  35.35 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  35.35 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  33.04 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  38.32 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  35.94 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2481  lipoprotein signal peptidase  41.76 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  38.32 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  46.88 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.62 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  28.77 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.62 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  40.2 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.61 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  35.35 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  40.2 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.61 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  37.72 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  40.2 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.14 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  30.91 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  34.68 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  35.96 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>