More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0163 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0163  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 524 aa  1082    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 501 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.47 
 
 		 498 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 498 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 631 aa  382  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 583 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 523 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 573 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 562 aa  373  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0997  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 569 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00135477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 573 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1187  lysyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0922785  hitchhiker  0.00801016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 501 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 489 aa  369  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  42.69 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 508 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 573 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 504 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1067  lysyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.433368  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0619  lysyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0903  lysyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 512 aa  364  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 504 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 491 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 515 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4009  lysyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 567 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 491 aa  360  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 502 aa  360  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2161  lysyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 496 aa  360  5e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000571826 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  40.2 
 
 		 496 aa  359  5e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 514 aa  359  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 497 aa  358  9e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 502 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 499 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 647 aa  357  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 508 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 508 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2240  lysyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 503 aa  356  6.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 494 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>